基因组学成本计算工具，用户手册，第2版

用户手册 第二版 基因组学成本工具 用户手册 第二版 基因组学成本工具：用户手册，第二版 ISBN 978-92-4-011884-3（电子版）ISBN 978-92-4-011885-0（印刷版） © 世界卫生组织 2026 部分版权所有。本作品可在Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 3.0 IGO许可下使用（CC BY-NC-SA 3.0IGO；https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/igo). 根据本许可协议的条款，您可以复制、分发和修改本作品，用于非商业目的，但前提是您必须按照以下说明正确引用本作品。在使用本作品时，不得暗示世界卫生组织（WHO）支持任何特定的组织、产品或服务。禁止使用世界卫生组织（WHO）的标志。如果您修改本作品，则您必须以相同的或等效的知识共享许可协议（Creative Commons license）对您的作品进行许可。如果您创建本作品的翻译版本，...“在您的作品中，请在建议的引用信息旁边添加以下免责声明：本翻译并非由世界卫生组织（WHO）创建。WHO不对本翻译的 内容或准确性负责。以原始英文版本为准则和权威版本。 任何与许可下产生的纠纷相关的调解，应按照世界知识产权组织的调解规则进行。http://www.wipo.int/amc/en/mediation/rules /). 建议引用基因组学成本计算工具：用户手册，第二版。日内瓦：世界卫生组织；2026。许可证：CC BY-NC-SA 3.0 IGO. 出版物著录数据。出版物著录数据可在https://iris.who.int/获取。 销售、权益与许可。要购买世界卫生组织出版物，请参阅https://www.who.int/publications/book-orders为提交商业用途请求以及有关版权和许可的咨询，请参阅https://www.who.int/copyright. 第三方材料。如果您想重新使用此作品归功于第三方的材料，如表格、图形或图像，您有责任确定是否需要获得许可，并从版权所有者那里获得许可。由于作品中的任何第三方拥有的组件侵犯而产生的索赔风险完全由用户承担。 一般免责声明。本出版物所使用的名称和材料的表述，并不代表世界卫生组织对任何国家、地区、城市或其当局的法律地位，或其边界或边界的划定有任何意见。地图上的虚线和虚线表示可能尚未完全达成一致的大致边界线。 提及特定公司或某些制造商的产品并不表示它们得到了WHO的支持或推荐，也不意味着它们相对于未提及的具有相似性质的产品具有优先权。除非有误，否则专有产品名称以首字母大写来区分。 世界卫生组织已经采取所有合理的预防措施来核实本出版物所包含的信息。然而，所发表的材料将未经任何形式的保证分发，无论是明确的还是隐含的。对材料的解释和使用责任在于读者。在任何情况下，世界卫生组织都不会对其使用引起的损害承担责任。 设计及布局由安东尼奥·佩雷斯完成。 目录 致谢 缩略语 术语表 引言目的 目标受众 软件需求 其他备注 致谢 世界卫生组织（WHO）谨向为这份文件的制定做出贡献的许多个人表示感谢。 第二版基因组成本工具（GCT）及其用户手册由四家机构共同开发：公共卫生实验室协会（APHL）、FIND、英国健康安全局（UKHSA）和世界卫生组织（WHO）。 领导与协调 世界卫生组织为GCT的开发和发布提供了领导和协调。该工具的技术开发由亚历山大·亚古帕罗夫（欧洲区域办事处，传染病危害管理，世界卫生组织）领导，在乔安娜·萨尔维·勒加雷克·兹维蒂恩加（欧洲区域办事处，传染病危害管理，世界卫生组织）的监督下进行。用户手册的开发由阿什利·博尔丁（美国公共卫生实验室，美国）和托尼·惠斯特勒（美国公共卫生实验室，美国）共同领导。奥卢沃托辛·乌鲁拉奥拉·阿坎德（世界卫生组织总部，流行病和疫情管理部）领导了GCT项目的整体协调工作。 核心技术团队 以下GCT工作组成员通过参与GCT及其用户手册的范围界定、技术概念、开发、撰写和审阅，做出了重要的智力贡献：Babak Afrough（英国健康安全局，英国及北爱尔兰联合王国），Oluwatosin Wuraola Akande（世界卫生组织流行病和疫情管理部，世界卫生组织总部），Ashley Bolding（美国公共卫生实验室协会），Alexandr Jaguparov（传染病危害管理，世界卫生组织欧洲区域办事处），Beatrix Kele（英国健康安全局，英国），Marco Marklewitz（全球抗感染药物发现基金会，瑞士），Biran Musul（世界卫生组织土耳其国家办事处），Angela Poates（美国公共卫生实验室协会），Joanna Salvi Le Garrec Zwetyenga（传染病危害管理，世界卫生组织欧洲区域办事处），Toni Whistler（美国公共卫生实验室协会），Aude Wilhelm（英国健康安全局，英国；世界卫生组织大流行和疫情情报中心，世界卫生组织总部）。 贡献者 以下人员为工具的范围和审查提供了支持：Silvia Argimon（世界卫生组织流行病和传染病情报中心，世界卫生组织总部）、Josefina Campos（世界卫生组织流行病和传染病情报中心，世界卫生组织总部）、Soudeh Ehsani（世界卫生组织欧洲区域办事处传染病、环境和健康司）、Sophia Georghiou（世界卫生组织结核病和肺部健康全球项目，世界卫生组织总部）、Nicksy Gumede-Moeletsi（世界卫生组织非洲区域办事处）、Noah Hull（美国公共卫生实验室协会）、Adolfo Lara（美国公共卫生实验室协会）、Miguel Moreno-Molina（瑞士 FIND）、Dmitriy Pereyaslov（世界卫生组织总部流行病和 Pandemic 管理司）、Julia Pringle（美国公共卫生实验室协会）、Jessica Rowland（美国公共卫生实验室协会）、Anita Suresh（瑞士 FIND）、Swapna Uplekar（瑞士 FIND）。 外部评审员 The GCT working group expresses its heartfelt gratitude to all the institutions and public health laboratories whose collaborative efforts in the tool review and pilot exercise were instrumental in validating the second edition of the GCT: Zhyldyz Atambekova (Kyrgyz Research Institute of Veterinary Medicine namedafter Arstanbek Duisheev of the Ministry of Agriculture of the Kyrgyz Republic, Kyrgyzstan), Soany Mariela Avilez (National Health Surveillance Laboratory/National Virology Laboratory of the Ministry of Health (SESAL), Honduras), Zhyldyz Bekturova (Laboratory of Molecular 遗传学和病毒学，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部疾病预防和国家卫生流行病学监测司（Veronica Burlac，摩尔多瓦共和国公共卫生国家局基因组测序国家参考实验室，摩尔多瓦共和国；Valeria Ceban，摩尔多瓦共和国公共卫生国家局基因组测序国家参考实验室，摩尔多瓦共和国；Elena Chesov，摩尔多瓦共和国尼古拉·特塞米图努国立医学与药学大学个性化医疗中心遗传学实验室；Nelly Ciobanu，摩尔多瓦共和国肺病PMSI“奇里尔·德拉甘纽克”研究所国家结核病参考实验室；Alexandru Codreanu，摩尔多瓦共和国肺病PMSI“奇里尔·德拉甘纽克”研究所国家结核病参考实验室；Svetlana Colac，摩尔多瓦共和国公共卫生国家局基因组测序国家参考实验室，摩尔多瓦共和国；Tolkun Isakova，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部国家肺病中心国家参考实验室，吉尔吉斯斯坦；Baarinisa Iskanova，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部控制血源性病毒性肝炎和艾滋病的共和中心病毒性肝炎和艾滋病毒诊断参考实验室；Gulmira Kalmambetova，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部国家肺病中心国家参考实验室，吉尔吉斯斯坦；Khoo Yoong Khean，新加坡杜克-新加坡国立大学传染病预防中心；Shurendar Selva Kumar，新加坡杜克-新加坡国立大学传染病预防中心；Gulshan Mataeva，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部国家肺病中心国家参考实验室，吉尔吉斯斯坦；Gulmira Orozalieva，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部疾病预防和国家卫生流行病学监测司分子遗传学和病毒学实验室；Paul Michael Pronyk，新加坡杜克-新加坡国立大学传染病预防中心；Stela Racovita，摩尔多瓦共和国尼古拉·特塞米图努国立医学与药学大学个性化医疗中心遗传学实验室；Karla Dariela Romero，洪都拉斯卫生部国家卫生监测实验室/国家病毒学实验室（SESAL）；Adyl Ryspaev，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部疾病预防和国家卫生流行病学监测司分子遗传学和病毒学实验室；Gulbarchyn Saparova，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部国家肺病中心国家参考实验室，吉尔吉斯斯坦；Victor Sitnic，摩尔多瓦共和国公共卫生国家局基因组测序国家参考实验室，摩尔多瓦共和国；Alexandra Suruceanu，摩尔多瓦共和国公共卫生国家局基因组测序国家参考实验室，摩尔多瓦共和国；Meerbubu Sydykova，吉尔吉斯斯坦共和国卫生部国家肺病中心国家参考实验室，吉尔吉斯斯坦；Ada Mariela Vidal，洪都拉斯卫生部国家卫生监测实验室/国家病毒学实验室（SESAL）；Ecaterina Zazuc，摩尔多瓦共和国公共卫生国家局基因组测序国家参考实验室，摩尔多瓦共和国）。 利益声明 根据世界卫生组织与非国家行为体互动框架（FENSA），所有非国家行为体都获得了参与本工具的联合开发和审查的许可。 所有外部专家向世界卫生组织提交了利益声明，披露了可能影响或合理地被认为可能影响其就文件主题而言的客观性和独立性的潜在利益冲突。世界卫生组织审查了每一份声明，并得出结论，没有任何一份声明可能引发与文件所涉主题相关的潜在或合理地被认为可能存在的利益冲突。 财务捐助 以下机构衷心感谢为该工具的开发和发布提供财务支持的贡献： yAPHL得到了美国疾病控制与预防中心的资助，该资助是在合作协议NU2HGH000080下进行的。yFIND 由Unitaid 和荷兰企业局支持y世界卫生组织得到了澳大利亚外交部和贸易部根据VCS S DFAT WHE 23–27项目以及国际病原体监测网络（世界卫生组织大流行和流行病情报中心）的支持。 缩写 APHL.公共卫生实验室协会GCT基因组成本工具L&W年度许可及保修费（ONT）Mb兆碱基MGI（根据上下文，这可能是指“Machine Generated Intelligence”即“人工智能”，也可能是其他特定缩写。由于没有具MGI科技有限公司下一代测序 (Xià yī dài cè sù)下一代测序ONT牛津纳米孔技术PCR聚合酶