AI正在从DBTL循环的全流程环节、运行效率、底层能力等多个维度对传统合成生物研发体系实现重构,相关情况可以梳理为以下几个部分:
一、AI重构DBTL循环的核心逻辑
传统DBTL循环原本高度依赖长期反复的人工实验试错,受现有基因工程、代谢工程技术水平限制,很难直接完成复杂生物系统的理性设计,只能通过多轮迭代逐步修正优化微生物细胞工厂 【7】 。而AI凭借海量数据学习能力、未知空间探索能力,可覆盖基因注释、蛋白质功能预测、基因线路预测、代谢网络预测、复杂微生物群落表征等多个核心场景,从根本上加快DBTL的整体循环效率 【8】 。
二、AI对DBTL各环节的针对性升级
- 设计环节:以往设计阶段主要依托现有标准化生物元件做理性设计,AI赋能的生物工具可以跳出原有框架,从大型数据集中挖掘隐藏模式,自主生成全新的构思和设计方案,比如在药物研发场景中,这类工具几天内就能生成数千个潜在候选分子,人工研发往往需要耗费数年时间才能完成同等工作量 【3】 。目前AI还已经落地到元件工程场景,大幅提升生物元件的鉴定和功能注释效率,既可以加快天然生物元件的优化速度,甚至已经支持人类从头设计全新的基因、蛋白质元件,比如中科院深圳先进研究院就借助机器学习框架优化启动子组合,研发出了高效的通用型底盘细胞 【8】 。
- 构建环节:AI可以和自动化实验室能力深度结合,把设计阶段输出的数字方案更高效地转化为可落地的物理生物系统,大幅提升该环节的运行吞吐量,减少人工操作带来的误差和效率瓶颈 【3】 。
- 测试环节:AI可以搭配微流控芯片、先进光谱传感器、高通量筛选等技术,更精准高效地完成细胞工厂实用性评估,自动识别测试过程中的异常结果,筛选出符合性能要求的改造菌株,避免无效数据流入后续环节。
- 学习环节:AI可以自动完成多源异构实验数据的整合、分析和建模,从过往的构建、测试结果中提炼规律,直接为下一轮循环的设计优化提供明确指导,替代传统依赖人工经验的试错总结模式,形成正向迭代的知识生成闭环 【3】 。
三、AI重构DBTL的落地价值
经过AI升级后的DBTL循环,既保留了原本的反馈迭代特性,又兼顾了生物系统本身的复杂性和变异性,把AI驱动的建模预测和真实实验验证深度结合,大幅降低合成生物研发的试错成本,推动整个合成生物学市场进入加速扩张阶段 【3】 【7】 。