呼吸道病毒综合监测报告规范
简介
本报告规范描述了在欧盟/欧洲经济区以及世界卫生组织欧洲区域进行呼吸道病毒监测(包括流感样疾病(ILI)、急性呼吸道感染(ARI)、重症急性呼吸道感染(SARI)、流感、SARS-CoV-2和RSV)的数据收集流程。从2026年6月起,所有呼吸道病毒监测数据均报告至EpiPulse Cases,病毒特征数据仍可通过TESSy的INFLANTIVIR和可选的NCOVVARIANT记录类型报告(相关报告规范)。
报告规范旨在通过以下方式提高用户友好性:
- 引入统一结构,方便数据管理员在不同主题间查找数据收集信息;
- 删除与数据管理员无关的信息。
如何使用本文件
本报告规范为报告国家的数据管理员提供以下三部分信息:
- 向EpiPulse Cases报告:包含准备数据提交至EpiPulse Cases的指南以及进一步信息的链接。
- 附件1:提供报告主题代码的介绍和概述。
- 附件2:概述提交定量数据的注意事项。
- 附件3:概述提交定性指标(RESPIQUAL)的注意事项。
- 附件4:概述提交阈值的注意事项。
- 附件5:提供所有变量的列表。
向EpiPulse Cases报告
EpiPulse Cases旨在取代TESSy,以改进监测数据的报告、审查和更新流程。报告流程如下:
- 熟悉数据收集截止日期。
- 准备(导出和转换)数据。
- 确认数据符合EpiPulse Cases元数据(参见EpiPulse帮助)。
- 确认数据来源是最新的。
- 将文件提交至EpiPulse Cases。
- 最终确定并批准提交。
检查数据收集计划
当前数据收集计划链接可在EpiPulse帮助中找到。
准备数据
从国家数据库导出数据后,需要确保数据格式为EpiPulse Cases可接受的格式。EpiPulse Cases仅接受CSV和XML文件,可选ZIP压缩。EpiPulse Cases元数据基于TESSy元数据开发,旨在仅进行最必要的更改,并希望为向ECDC报告数据集提供更好的体验。
使用最新元数据
元数据定义了作为给定主题输入到EpiPulse Cases的有效字段和数据格式。EpiPulse Cases元数据包括一个比较和突出TESSy和EpiPulse Cases之间更改的部分,以促进过渡。
检查您的监测系统描述符
在提交文件之前,请查看EpiPulse中的数据源(菜单中,转到“报告”->“监测系统描述符”),并根据需要更新信息。
上传数据
通过EpiPulse网络界面(菜单中,转到“病例”->“EpiPulse Cases”)提交数据。
最终确定您的提交
在数据上传过程中,系统会自动检查数据是否符合元数据中的验证规则。在EpiPulse Cases中,此过程称为“技术验证”,并且只有当文件格式不可读或(很少)技术上必需的变量缺失时,系统才会拒绝您的上传。
EpiPulse Cases帮助台
邮箱:EpiPulseCases@ecdc.europa.eu
电话号码:+46-(0)8-5860 1601
可用时间:9:00 – 16:00 斯德哥尔摩时间,周一至周五(除ECDC假日外)。
附件1. 报告概述
数据收集分为七个综合主题代码:
- RESPICLINPC:报告每周按年龄分组的初级保健综合征数据(ILI/ARI)。
- RESPIAGGR:报告来自ILI/ARI监测和病原体特异性实验室监测系统的按年龄分组的检测和检测计数。
- RESPICLINSC:报告每周按年龄分组的二级保健综合征数据(SARI)。
- RESPISEVERE:报告来自SARI监测和病原体特异性实验室监测系统的按年龄分组的检测和检测计数,以及因呼吸道疾病住院、ICU住院和死亡的人数。
- RESPICASE:报告严重病例的基于病例的数据,捕获单个病例的综合征和病毒学数据。
- RESPIQUAL:报告每周定性指标。
- RESPITHRESHOLD:报告收集的ILI、ARI和SARI阈值数据。
所有主题代码都允许综合报告综合征(ILI、ARI或SARI)和/或由病原体(s)确认感染的病例。
主题代码
- RESPICLINPC:初级保健咨询数据(ILI/ARI综合征)。
- RESPIAGGR:呼吸道病毒综合数据。
- RESPICLINSC:二级保健咨询数据(SARI综合征)。
- RESPISEVERE:呼吸道病毒严重程度指标。
- RESPICASE:严重病例的基于病例数据,捕获综合征和病毒学数据。
- RESPIQUAL:呼吸道病毒定性指标。
- RESPITHRESHOLD:呼吸道病毒阈值数据。
病例定义
病例应根据当前的欧盟病例定义报告。不收集疑似和可能病例的数据。
报告截止日期
除RESPITHRESHOLD外,所有主题代码的截止日期为周三23:59 CET。
数据共享
有关EpiPulse数据治理的信息,请参阅ECDC网站上发布的ECDC数据治理政策。
附件2. 报告定量数据
本附件概述了提交至以下主题代码的注意事项:RESPICLINPC、RESPIAGGR、RESPICLINSC、RESPISEVERE或RESPICASE。
监测类型
- SYND:病例使用综合征病例定义(如ILI、ARI、SARI)识别,包括使用电子健康记录(EHR)数据尝试复制传统病例定义的情况。
- PATH:病例识别基于对病原体(流感、RSV、SARS-CoV-2)的阳性检测或反映病原体特异性诊断的EHR诊断代码。
综合数据分母
在SYND系统中,可以报告两种不同的分母:
- RESPICLINPC:使用Indicator = DENOMCONSULT报告所有原因的就诊次数,使用Indicator = DENOMPOP报告辖区人口。
- RESPICLINSC:使用Indicator = DENOMADMIT报告所有原因的住院次数,使用Indicator = DENOMPOP报告辖区人口。
检测分母
可以报告检测分母,无论SurvType如何。它们可用于计算检测阳性率。在基于病例的数据(RESPICASE)中,使用TestRSV、TestInfluenza和TestSARSCOV2变量报告接受检测的个体。这允许报告接受检测的个体,无论结果如何。如果报告了检测阴性的患者以及检测阳性的患者,则每病原体的检测总数是计算检测阳性率的检测分母。
年龄组
在RESPICLINSC、RESPIAGGR和RESPISERVE中,国家可以使用两种替代的年龄组集报告数据:
- 窄年龄组:00–04、05–14、15–29、30–64、65–79和80+岁。
- 宽年龄组:00–04、05–14、15–64和65+岁。
- 无法报告任何按年龄分组的国家的数据:AgeUnk。
混合感染
基于病例和综合主题代码,混合感染报告方式不同。
未知与缺失
在EpiPulse Cases中,如果某个变量没有数据报告或其值未知,则应留空。UNK不能报告,除非它明确包含在变量的参考列表中。
零与缺失
在ERVISS中,对缺失数据不进行任何假设。这意味着零必须明确报告,因为缺失值不会被重新编码为零。例如,在检测了某种病原体但所有结果均为阴性的周,请确保为Indicator = DETECTIONS报告值为0,以确保将其包含在ERVISS中,并计算0%阳性率。
EHR诊断代码
EHR诊断代码可以报告到RESPICASE,使用EHRDiagnosticCodes变量。这些代码可以报告为适用于每个患者的代码,包括那些用于定义呼吸道诊断以满足病例定义或与潜在健康状况相关的代码,使用以下格式:代码系统:代码系统版本:代码:主要(P)/次要(S)。例如,“ICD10:2019:J12.1:P”。
附件3. 报告定性指标
定性指标(QI)提供了对呼吸道疾病的传染性、严重性和影响的概述,这些指标使用阈值进行评估,允许对强度水平进行定性分类。向RESPIQUAL报告QI基于世界卫生组织流感大流行严重程度评估(PISA)指南(2025年),并进行了一些调整,以允许报告RSV和SARS-CoV-2。
我们优先考虑收集一组六项核心QI,用于每周综合形势评估和沟通:传染性(TRANS)和发病率&Morbidity & Mortality(MORB,优先考虑住院)对于流感、SARS-CoV-2和RSV。
综合报告流感、SARS-CoV-2和RSV
理想情况下,应使用类似的方法为每种病原体导出定性指标,以促进对报告的传染性和发病率&Morbidity & Mortality的综合评估。
流感传染性
流感传染性总结了该国内的流感活动,使用定性专家评估每周ILI/ARI趋势与先前季节的比较,或基于历史阈值的半定量方法(例如MEM或WHO),同时考虑流感病毒检测和综合征数据。
流感发病率和死亡率
流感发病率和死亡率捕获了流感对严重后果的影响。为了帮助历史和跨国家比较,我们建议国家使用住院指标而不是死亡率。如果无法做到这一点,可以使用自由文本评论字段来指定定性评估的基础数据(例如ICU住院、死亡率)。
其他报告注意事项
PISA指南列出了可用于报告每个指标的大量参数。报告国家可以根据其监测系统选择要报告哪些指标。对于每个指标,都有非强制性的评论和置信变量。
附件4. 报告阈值
RESPITHRESHOLD的引入允许国家报告和更新计算的阈值数据。目前可以报告ILI、ARI和SARI阈值数据。在2026/2027季节之前,ECDC和WHO欧洲区域办事处计算出的阈值与各国进行了验证。阈值数据以EpiPulse Cases兼容的元数据格式共享,并附有可视化阈值设置的图表。
国家可以选择使用ECDC和WHO计算的阈值或应用国家阈值方法。但是,每个指标(ILI、ARI或SARI)应报告仅有一种阈值方法。如果为同一指标提交了多种方法,则仅在ERVISS中显示最近报告的方法。使用的阈值方法必须在ThresholdMethod变量中指定。
附件5. 元数据
本附件提供了所有变量的列表,这是自动生成的,与Excel文件中的元数据相同。