NSFC自1990年起持续资助燃料电池基础研究，在“十一五”和“十二五”期间资助数量和金额快速增长，“十三五”期间有所下降，但资助强度整体上升。NSFC资助项目以探索系列的面上项目和人才系列的青年科学基金项目为主，集中在高校，中国科学院大连化学物理研究所和长春应用化学研究所科研实力突出。NSFC资助的燃料电池主要分为氢氧燃料电池和生物燃料电池，涵盖整个产业链，包括氢气生产、燃料电池系统以及应用领域如燃料电池汽车、环境保护等。研究热点集中在质子交换膜燃料电池和固体氧化物燃料电池，以及催化剂、电极和电解质等核心技术体系。NSFC资助对推动我国燃料电池基础研究和产业发展起到了重要作用。
