原子算筹（ABACUS）软件使用和开发手册V0.2版本

ABACUSV0.2 ABACUS202626 1 1.1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .11.2ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51.3V0.1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .131.4V0.2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .13 2152.1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .152.1.1GCCABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .152.1.2Intel oneAPI 2024/2025ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .182.1.3Intel oneAPIABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .262.1.4ToolchainABACUS(1) – GCC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .282.1.5ToolchainABACUS(2) – Intel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .382.1.6ToolchainABACUS(3) – AMD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .532.1.7Nvidia GPUABACUS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .632.1.8ABACUS LCAOGPU. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .642.1.9ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .732.1.10ABACUSDCUAMD. . . . . . . . . . . . . . . . . . .752.1.11ABACUS-i/-I/–info. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .792.2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .812.2.1ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .812.2.2ABACUSSTRU. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .852.2.3ABACUS. . . . . . . . . . . . . . .922.2.4ABACUS. . . . . . . . . . . . .952.2.5ABACUS. . . . . . . .1022.2.6. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1112.2.7ABACUS. . . . . . . . . . . . . .1222.2.8. . . . . . . . . . . . . . . . . .1252.2.9. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1342.3Kohn-Sham. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1382.3.1ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1382.3.2ABACUS+LibRI. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1452.3.3ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1492.3.4ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1532.3.5ABACUSv0.2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1562.4. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1612.4.1ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1612.4.2ABACUS+DeePMD-kit. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1712.4.3ABACUS+DPA-3Bohrium. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1752.5AI. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1772.5.1ABACUS+DPGEN. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1772.5.2DeePKS-ES. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .189 2.6. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .202 2.6.1ABACUSDFT. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2022.6.2ABACUSDFT. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2062.6.3ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2092.6.4ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2152.6.5ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .220 2.7.1ABACUS+Atomkit. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2232.7.2ABACUSPDOS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2302.7.3ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2342.7.4ABACUSELF. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2432.7.5ABACUS+Bader charge. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2462.7.6ABACUS+pymatgen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2552.7.7ABACUS+Phonopy. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2582.7.8ABACUS+Phonopy. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2622.7.9ABACUS+ShengBTE. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2692.7.10ABACUS+Wannier90. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2732.7.11ABACUS+Candela. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2762.7.12ABACUS+USPEX. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2802.7.13ABACUS+Hefei NAMD. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .287 3 291 3.1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .291 3.1.1ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2913.1.2ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .2943.1.3ABACUS. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .