组织设计的目的是为了反映企业战略、市场定位、客户价值及核心竞争能力，注重经济效益，体现业务流程，促进绩效，并提高运作效率。组织设计直接要回答的问题包括专业细分、组织形状、权利分配和部门设置。
在专业细分方面，专业分割越细，工作完成越出色，但整合这些工作需要更多时间和精力。高端组织倾向于按专业细分，追求深度知识与市场经验积累；中低端组织则实行一岗多能，减少协调，提高效率。
组织形状由主管直接汇报下属人数决定，当前趋势是向扁平化过渡，即增加主管下属人数，降低组织层数。扁平化程度受主管和下属的专业知识经验、主管授权和目标制定技能、直接下属工作性质区别以及下属工作关联性和易衡量程度等因素影响。
权利分配分为纵向和横向两方面。纵向权利分配指自上而下的决策权集中或非集中控制，当前趋势是下放决策权给靠近客户和产品开发的部门。横向权利分配指不同部门间权利的平衡，根据经营状况所需而变化，目的是争取最大商业利益。
部门设置分为职能型、产品型、客户型、地理分布型和矩阵型。职能型结构适用于产品类别区别不大、销售目标市场相同、专业经验可形成经济规模等情况，优点是有利于专业职能发展和资源集中利用，缺点是协调工作量大。产品型结构适用于不同产品针对不同客户、产品开发和生命周期较短等情况，优点是有利于围绕产品业务发展，缺点是各部门容易形成独立王国。客户型结构适用于客户类别非常重要、对不同类别客户有不同政策等情况，优点是有利于从客户需求出发进行产品/服务组织，缺点与产品型结构相似。地理分布型结构适用于产品本身价值和运输价值比较低、必须上门完成的服务等情况，优点是有利于及时送货并降低运输成本，缺点与产品型结构相似。矩阵型结构适用于对创新有要求、需要智囊团和信息技术支持等情况，优点是同时利用专业和产品经验，缺点是双向汇报关系复杂。
四种结构形式除职能型为成本中心外，其他均可采用利润中心或事业部方式运作。是否采用事业部式还需考虑经营规模、成熟度、成本与收益、绩效管理等因素。
组织设计与企业战略和价值定位密切相关。企业战略和价值定位可分为最佳产品、最佳方案和最佳成本三种类型。最佳产品型企业以最佳产品功能或式样领先竞争，特征是艺术级功能、最优性能，代表企业有耐克、强生婴儿药品等。最佳方案型企业以密切的客户联系领先竞争，特征是建立解决方案、知识共享，代表企业有雅方化妆品、惠氏婴儿奶粉等。最佳成本型企业以低成本低价格大规模销售在市场上竞争，特征是可靠的产品、具有竞争力的价格，代表企业有戴尔电脑、沃尔玛大卖场等。
最佳产品型企业具有极强的创新能力，核心竞争能力定义包括开发领先产品、提供超越市场水平的服务与产品、包容不同想法、快速将想法变为商业产品等。组织结构和人力资源体系特征包括扁平、松散的组织结构、产品设计营销人员共同协作、强大的营销功能部门、客户和产品类别管理人员共同协作、将创新能力作为员工选择标准等。
最佳方案型企业具有建立紧密客户关系的能力，核心竞争能力定义包括建立关系、深入理解客户需求、提供有广度和深度的服务、根据客户需求改造服务与产品等。组织结构和人力资源体系特征包括客户小组关注重要客户、合并销售和服务组织、建立全国级和跨国级客户组织、将响应能力作为员工选择标准等。
最佳成本型企业具有端到端流程优化能力，核心竞争能力定义包括流程优化、标准化、简单化、集成化、可靠高速处理等。组织结构和人力资源体系特征包括各团队组关注端到端流程、强化内部审计功能、成立独立部门关注运营标准、将可靠性作为员工选择标准等。
